神社内的职位排名称为职阶。根据神社的规模和由绪有所不同，通常会设有“宫司”、“祢宜”和“権祢宜”。原则上，宫司和祢宜在每个神社各有一名。在某些特别的神社中，宫司之下会设有“権宫司”或多名祢宜。简单来说，宫司是神社的代表，権宫司是副代表，祢宜是宫司的助手，而权祢宜是一般职员。权祢宜以下的是初级神职，通常大型的神社会设置这些职位，如“宫掌”、“主典”、“典仕”、“出仕”，以及是神道课程学生的“出仕前”、“实习生”和“研修生”等。此外，还有临时代行的职位，如“宫司代务者”。
由于历史和文化习俗等的原因，伊势神宫被定为神社本厅之本宗，和日本的总氏神。因此神社本厅及其所属的79094座神社，将伊势神宫定为神社本厅的信仰中心，和神社本厅中最尊贵的神社[6][7]。在伊势神宫中，则特别设置“祭主”（名义上的最高神职，通常由已经出嫁的天皇女儿担任，需要由天皇敕旨任命）、“大宫司”（伊势神宫运作上的最高负责人，通常由旧皇族成员的男性后裔担任，任命时需要提请天皇的批准）、“少宫司”、“祢宜”、“权祢宜”、“宫掌”、“出仕”和“出仕前”。
职阶
解释
祭主
只在伊势神宫设置，通常由已结婚的天皇女儿担任。伊势神宫名义上的最高神职，不参与日常运作。通常只参与、出席和主持大型的祭典。需要由天皇的敕旨任命。
大宫司
只在伊势神宫设置，伊势神宫的最高负责人，通常由旧皇族的男性后裔担任。通常只参与和负责较重要的工作，例如策划和主持式年迁宫及其他重要活动/祭典。任命时需要提请天皇的同意。
少宫司
只在伊势神宫设置，相当于其他神社的宫司。伊势神宫排名第二的神职，日常运作的负责人。
宫司
神社的代表和负责人，相当于公司的董事长。
权宫司
神社的副代表和第二负责人，相当于公司的董事。
祢宜
神社的主管级人员，相当于公司的经理或主管。
权祢宜
大型神社的高级或有经验的神职人员。
普通神社的一般神职人员。
宫掌、主典
一般或初级的神职人员，通常只在大型神社设置。
典仕、出仕
刚入职的神职人员，通常只在大型神社设置。
出仕前、研修生、实习生
通常是授予见习中的神职人员，或是在神社实习的神道课程学生。
除了神职之外，神社还设有事务职如“参事”、“录事”、“主事”、“主事补”，宗教职如“教导司”和“教学司”，以及其他专业职位如“伶人”、“技监”、“技师”、“庭师”、“卫士”和“守卫”。此外，“巫女”和“舞女”不属于神职。
此外，无论神社大小，只要是属于神社本厅的宫司或宫司代务者，若为宗教法人，则作为代表役员地位是平等的。例如，别表神社的宫司和地方小神社的宫司，在影响力上虽有差异，但作为代表役员的地位是相同的。需要注意的是，职阶和阶位是不同的，职阶较高者在神职中的地位也较高。例如，正阶或権正阶的宫司高于明阶的祢宜或権祢宜。
根据神社本厅的宗教法人规则“宗教法人‘神社本厅’厅规”第78条规定，“以宫司为代表役员，以宫司代务者为代表役员的代务者”。根据同庁规第90条第1项，“宫司及宫司代务者的进退由代表役员以外的役员具申，统理进行。但当统理认为必要时，可在获得代表役员以外的责任役员同意后进行进退”。第91条规定，“権宫司的进退由宫司具申，经役员同意后由统理进行”。而“祢宜以下的进退由宫司具申，经统理进行”。此外，神社本厅的“役职员进退相关规程”规定宫司和别表神社的権宫司的任免由“统理进行”，其他神职则由“在统理指挥下由都道府县神社厅长进行”。
在伊势神宫中，根据宗教法人规则“神宫规则”，祭主的任命是“由天皇的敕旨定夺”（神宫规则第30条第1项后段），伊势神宫大宫司的任免则需“获得伊势神宫崇敬者总代的同意，并由神宫责任役员〔神宫少宫司及由崇敬者总代会选出的责任总代〕连署后，向天皇请示”（神宫规则第32条）。伊势神宫少宫司的任免则由伊势神宫大宫司在获得神宫崇敬者总代的同意后进行（神宫规则第33条），而其他神职的任免则由“大宫司进行”（神宫规则第34条）。